1型主要存在于呼吸道、唇、口、眼结膜、角膜和皮肤，可引起腰以上部位的病损，上述部位发生的疱疹99%是1型病毒引起的。
2型病毒主要存在于男女生殖器部位，如男性的阴茎、尿道、宫颈等处。生殖器官发生的疱疹90%是2型病毒所引起。
